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In short: choose Shopify Payments if you run a Shopify store, since it's built in, avoids Shopify's third-party transaction surcharge (0.5–2% depending on plan), and its rates drop on higher Shopify tiers. Choose Stripe if you need a customizable, developer-friendly platform for a custom site, marketplace, or multi-platform/international business. Both charge roughly 2.9% + 30¢ online and a $15 chargeback fee, and Shopify Payments actually runs on Stripe's infrastructure.
Stripe and Shopify Payments are prominent players in the multi-trillion-dollar global eCommerce industry. These two payment processors are top-of-mind for merchants, each offering distinct features for different use cases. Stripe is a full-stack, customizable digital payment service; Shopify Payments is an embedded processor designed for Shopify merchants. This deep dive compares features, pricing, and fit so you can choose with confidence.
| Factor | Stripe | Shopify Pagos |
|---|---|---|
| Tipo | Plataforma de pagos independiente (para cualquier sitio web) | Procesador integrado para tiendas « Shopify » |
| Tarifa en línea | 2,9 % + 30 céntimos | 2,9 % + 30 céntimos (menor en los planes de mayor importe) |
| Tarifa presencial | 2,7 % + 5 céntimos | 2,4 %–2,7 % + 5 céntimos |
| Cuota mensual | Ninguno (sistema de reparto) | Incluido en tu plan « Shopify » |
| Recargo por servicios de terceros | N/A | Entre el 0,5 % y el 2 % si no utilizas los pagos de « Shopify » |
| Comisión por devolución | $15 | $15 |
| Disponibilidad | Más de 46 países; más de 135 monedas | ~23 países; más de 130 monedas |
| Ideal para | Desarrollos a medida, mercados, multiplataforma | Shopify tiendas que buscan una solución «todo en uno» |

Stripe's unique selling proposition is offering robust APIs that are easy to integrate and customize. This API-first approach makes Stripe a developer-centric company, and it works. Stripe facilitates card-present payments through POS terminals and offers financing to businesses managing early cash flow, while continually refining its UI and developer tools to reduce payment friction.
La envergadura Stripe pone de relieve su posición: según Stripe recientes Stripe , la empresa procesó un volumen total de pagos de 1,9 billones de dólares en 2025 (un 34 % más que el año anterior) y alcanzó una valoración de 159 000 millones de dólares en una oferta pública de adquisición realizada en febrero de 2026. Más de 5 millones de empresas utilizan Stripe, que declara un tiempo de actividad del 99,99 %.
Stripe gives you a feature-rich payment suite to simplify online transactions – from sign-up to scale-up, with tools to manage subscriptions, optimize revenue, prevent fraud, and expand globally. Notable Stripe features include:
Stripe charges no subscription for standard payment processing; you pay a commission per transaction:

Shopify Payments is an in-built payment processor that lets Shopify merchants collect and process payments natively, with no third-party integration required. Shopify partnered with Stripe to launch it in 2013 as a white-labeled solution, and it remains built on Stripe's infrastructure. Alongside it, Shopify offers a POS solution for brick-and-mortar sales that unifies online and in-store data.
Con millones de empresas en la plataforma, Shopify Payments es la opción predeterminada para muchos comerciantes. Está disponible en unos 23 países, y Shop Pay permite a los compradores finalizar la compra rápidamente, al tiempo que mantiene unificados los datos de pago y ventas dentro del ecosistema de Shopify .
There's no separate subscription for Shopify Payments; it's included in your Shopify plan (paid plans start around $39/month for Basic). Processing fees depend on your plan:
Stripe setup can require more technical work, from a quick install to a custom API build (Stripe estimates one week to three months). Shopify Payments comes native in your plan; you just turn it on.
Ambas ofrecen numerosas opciones de pago, una seguridad sólida y la posibilidad de personalizar la marca. La diferencia clave: « Shopify Payments» solo está disponible para los comerciantes de Shopify , mientras que Stripe funciona en cualquier plataforma.
Base rates are similar (~2.9% + 30¢ online), and both charge a $15 chargeback fee and a 1% cross-border fee on foreign-issued cards for US businesses. The big difference: Shopify Payments requires a Shopify subscription but avoids the 0.5–2% third-party surcharge that applies when you route payments through Stripe (or any other gateway) on Shopify.

En el caso de las tiendas de « Shopify », « Shopify Payments» suele ser la mejor opción, ya que evita el recargo de terceros de Shopify y ofrece tarifas más bajas en los planes de mayor nivel. Para sitios web personalizados, mercados online o negocios multiplataforma o internacionales, la flexibilidad de Stripe resulta decisiva.
Sí. El uso de Stripe (o cualquier pasarela que no seaShopify ) en Shopify conlleva una comisión por transacción de terceros de entre el 0,5 % y el 2 % aproximadamente, dependiendo de tu plan de Shopify , además de la tarifa propia de Stripe.
Su tarifa básica en línea es la misma (2,9 % + 30 céntimos), y ambas cobran una comisión por devolución de 15 dólares. Shopify Las tarifas de Payments se reducen en los planes superiores de Shopify , mientras que Stripe se mantiene fija a menos que se negocien precios personalizados.
Sí, « Stripe » está disponible como pasarela de pago de terceros en Shopify, pero tendrás que pagar el recargo de Shopify además de las comisiones de Stripe. La mayoría de los comerciantes de Shopify utilizan Shopify Payments para evitarlo.
Chargeflow provides native apps for Stripe and Shopify, helping you win and prevent chargebacks without lifting a finger. Whichever processor you choose, pair it with automated chargeback protection and real-time chargeback prevention alerts, with success-based pricing, you only pay for cases won. Here's how to get started.

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